Il Giappone è un vasto arcipelago composto da quattro grandi isole e da altre 3000 isole di piccole dimensioni.
L'arcipelago si trova di fronte alla Cina, alla Corea del Nord e alla Corea del Sud (ovest) e alla Russia (nord).
A est si affaccia sull'oceano Pacifico.
Il territorio giapponese anche se abitato dall'antichità conserva tutt'ora una vasta copertura vegetale che occupa poco meno del 70% del territorio. Le limitate estensioni di vegetazione sono dovute a una notevole biodiversità sia per numero di specie sia per numero di endemismi.
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